新型冠狀病毒,即“2019-nCoV”——艾柏森生物首次表達相關蛋白
新型冠狀病毒,即“2019-nCoV”——艾柏森生物首次表達相關蛋白 副標題 新型冠狀病毒,即“2019-nCoV”——艾柏森生物首次表達相關蛋白 Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome Basic Information(基本信息)
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病原分離鑒定服務 基因組測序一般先將樣本制成勻漿并進行過濾,取上清用于RNA提??;提取的RNA在進行去除DNA和核糖體RNA后,通過體外隨機引物反轉錄進行建庫;測序在二代或三代高通量測序平臺進行。測序數(shù)據(jù)經(jīng)過質量控制,去除宿主基因組序列后進行拼接,此次病原學鑒定應該同時使用了二代和三代測序平臺,才能短時間內(nèi)獲得病毒的全基因組序列(本過程需要2~3天)。 獲得病毒全基因組序列后,通過設計引物進行PCR反應,可以對樣本的核酸進行檢測,來確定樣本中是否含有該病毒的核酸(本過程1~2天即可)。肺泡灌洗液、咽拭子、血液等宿主來源并包含病毒的物質稱病料,病毒分離時,傳代細胞系、原代細胞是常用的分離方法,動物接種、雞胚接種必要時也可用于病毒分離。分離成功的病毒,首選細胞培養(yǎng)的方式進行擴增,動物、雞胚和組織也可用于病毒擴增培養(yǎng),培養(yǎng)后的純病毒可用于鑒定、分型、感染特性和致病特性等研究(該過程時間一般較長,但由于有SARS的經(jīng)驗,順利的話3~5天)。 冠狀病毒簡介 冠狀病毒全基因組通常含有7個開放閱讀框,每相鄰兩基因之間存在間隔序列,5’端為非編碼區(qū)帽子結構,3’端為多聚腺苷酸非編碼區(qū);從5’端起約占據(jù)全基因組的三分之二的ORF1(包含ORF1a和1b)也稱為復制酶基因,負責編碼16個以上與病毒復制相關的非結構蛋白;靠近3’端的4個開放閱讀框,依次編碼S蛋白(spike protein)、E蛋白(envelope protein)、M蛋白(membrane protein)和N蛋白(nucleoprotein);S基因與M基因之間還含有一個非結構蛋白NS3。冠狀病毒通過棘突蛋白(S)受體結合區(qū)的基因重組或突變可以實現(xiàn)其從野生動物到人類的宿主范圍“跳躍”并導致高死亡率的疾病,如嚴重急性呼吸道綜合征(SARS)與中東呼吸系統(tǒng)綜合癥(MERS)。雖然SARS-CoV和MERS-CoV均來源于蝙蝠,但并不是直接感染人類,而是通過中間宿主實現(xiàn)其跨物種傳播。 疫情來源病毒相關信息 冠狀病毒是一類主要引起呼吸道、腸道疾病的病原體。這類病毒顆粒的表面有許多規(guī)則排列的突起,整個病毒顆粒就像一頂?shù)弁醯幕使冢虼说妹肮跔畈《尽?。冠狀病毒除人類以外,還可感染豬、牛、貓、犬、貂、駱駝、蝙蝠、老鼠、刺猬等多種哺乳動物以及多種鳥類。目前為止,已知的人類冠狀病毒共有六種。其中四種冠狀病毒在人群中較為常見,致病性較低,一般僅引起類似普通感冒的輕微呼吸道癥狀。另外兩種冠狀病毒——嚴重急性呼吸綜合征冠狀病毒和中東呼吸綜合征冠狀病毒,也就是我們簡稱的SARS冠狀病毒和MERS冠狀病毒,可引起嚴重的呼吸系統(tǒng)疾病。引起此次疫情的新型冠狀病毒不同于已發(fā)現(xiàn)的人類冠狀病毒,對該病毒的深入了解需要進一步科學研究。 國際病毒學分類委員會報告將冠狀病毒科分為四個屬即α、β、γ和δ屬。人冠狀病毒229E、人冠狀病毒NL63屬于α屬,人冠狀病毒OC43、人冠狀病毒HKU1、嚴重急性呼吸綜合征(SARS)屬于β屬。一般通過全基因組序列的多重比對后構建系統(tǒng)進化樹,可以確定分類。該新型冠狀病毒屬于哪一種,目前暫無報道。 我們的產(chǎn)品
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